RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572588.1

MKL2-206, Transcript of MKL/myocardin-like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene MKL2, Length 7,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL2-206	ENST00000572588	TRIM50	Q86XT4	487 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	FLT1	P17948	1338 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PCNT	O95613	3336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ABCA3	Q99758	1704 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	MYO1C	O00159	1063 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PSMD14	O00487	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	OPLAH	O14841	1288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	RAD17	O75943	681 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	KRT10	P13645	584 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	CDK8	P49336	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	STX1A	Q16623	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ATCAY	Q86WG3	371 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	GPC2	Q8N158	579 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	MAP7D2	Q96T17	732 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	GPAM	Q9HCL2	828 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ANO10	Q9NW15	660 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	QPCT	Q16769	361 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	RNF181	Q9P0P0	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	NEDD4	P46934	1319 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	KCNA3	P22001	575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	GALNT17	Q6IS24	598 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF280D	Q6N043	979 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	C6orf50	Q9HD87	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	POTEJ	P0CG39	1038 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	FGFR1	P11362	822 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	SHMT1	P34896	483 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ME1	P48163	572 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	RASA3	Q14644	834 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PPP2R5D	Q14738	602 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	AOC3	Q16853	763 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	BRD9	Q9H8M2	597 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	STX8	Q9UNK0	236 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MKL2-206	ENST00000572588	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CALML3	P27482	149 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	FAM160B2	Q86V87	743 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CEP63	Q96MT8	703 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	VEZT	Q9HBM0	779 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	MYH3	P11055	1940 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	UNCX	A6NJT0	531 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	MAP3K13	O43283	966 aa		3.34	□□□□□ -1.88
MKL2-206	ENST00000572588	CDC25A	P30304	524 aa		3.34	□□□□□ -1.88

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