RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567015.5

UTP4-208, Transcript of UTP4, small subunit processome component, human

TSL 2

Gene UTP4, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UTP4-208	ENST00000567015	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UTP4-208	ENST00000567015	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UTP4-208	ENST00000567015	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
UTP4-208	ENST00000567015	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UTP4-208	ENST00000567015	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UTP4-208	ENST00000567015	MAFG	O15525	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	FIBP	O43427	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	B4GALT4	O60513	344 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	F2	P00734	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	MYL3	P08590	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SCG2	P13521	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	RAG1	P15918	1043 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	DGKD	Q16760	1214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	GGPS1	O95749	300 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ITGB5	P18084	799 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	NEDD9	Q14511	834 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	EPHB4	P54760	987 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	NAPA	P54920	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SHH	Q15465	462 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	UBE2S	Q16763	222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CYP3A4	P08684	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	KCNA2	P16389	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	HOXC8	P31273	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SREBF1	P36956	1147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ADCY7	P51828	1080 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	FPGS	Q05932	587 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	RBL2	Q08999	1139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	MEIS1	O00470	390 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ATP9A	O75110	1047 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	SEC24B	O95487	1268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	1e-8	■■■■□ 23.7
UTP4-208	ENST00000567015	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PHKB	Q93100	1093 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	GPR20	Q99678	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CSF2RA	P15509	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	GNA11	P29992	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CYP2C18	P33260	490 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	PSEN2	P49810	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UTP4-208	ENST00000567015	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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