RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 SORBS3O60504 671 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 MMP3P08254 477 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PRR29P0C7W0 189 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ITGB5P18084 799 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ITGB8P26012 769 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ICAM3P32942 547 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 CDK7P50613 346 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 NEK4P51957 841 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PSMC6P62333 389 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 TLE2Q04725 743 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 NECAB1Q8N987 351 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 AFG1LQ8WV93 481 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 CUL5Q93034 780 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 GTF3C6Q969F1 213 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ANO3Q9BYT9 981 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 SZT2Q5T011 3432 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ELP1O95163 1332 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 B4DLN1 442 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 GH1P01241 217 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 SREBF1P36956 1147 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 KAT2BQ92831 832 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 GDF15Q99988 308 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 SPC25Q9HBM1 224 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 STK36Q9NRP7 1315 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC33-211ENST00000563951 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 M0R2N6 131 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 ARVCFO00192 962 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 JAK2O60674 1132 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 ATP9AO75110 1047 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 DEXIO95424 95 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 GGPS1O95749 300 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 MYL3P08590 195 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 KCNA2P16389 499 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 FAAP100Q0VG06 881 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 AP3B2Q13367 1082 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD1Q15327 319 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 TBX21Q9UL17 535 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CPLX1O14810 134 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 FIBPO43427 364 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 STAM2O75886 525 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CABYRO75952 493 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 F2P00734 622 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CD4P01730 458 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF286BP0CG31 522 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 CPT1AP50416 773 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 ITGA7Q13683 1181 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 GNPTABQ3T906 1256 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 PPTC7Q8NI37 304 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC33-211ENST00000563951 GPRASP2Q96D09 838 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms