RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559561.5

MEIS2-215, Transcript of Meis homeobox 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene MEIS2, Length 1,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEIS2-215	ENST00000559561	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	CHST13	Q8NET6	341 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	IL31RA	Q8NI17	732 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	ERMN	Q8TAM6	284 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	RAD54L	Q92698	747 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	SMTNL1	A8MU46	457 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	AP5Z1	O43299	807 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	PSMD10	O75832	226 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	ADCY5	O95622	1261 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	AMPD3	Q01432	767 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	MYL5	Q02045	173 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	KCNB1	Q14721	858 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	PGM5	Q15124	567 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	SARM1	Q6SZW1	724 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	PXMP2	Q9NR77	195 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MEIS2-215	ENST00000559561	HERVK_113	P62684	666 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	TPM4	P67936	248 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	PPP2R5C	Q13362	524 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	SNAPC2	Q13487	334 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	NCAPH	Q15003	741 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	SV2B	Q7L1I2	683 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	UIMC1	Q96RL1	719 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	RMDN3	Q96TC7	470 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	TRIM9	Q9C026	710 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	BTBD7	Q9P203	1132 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	FBXO40	Q9UH90	709 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	KLRC4	O43908	158 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ITGB5	P18084	799 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	RPA1	P27694	616 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	PLS1	Q14651	629 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ECM1	Q16610	540 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	KCNK18	Q7Z418	384 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	RIT2	Q99578	217 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	JADE2	Q9NQC1	790 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	PFAS	O15067	1338 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	POTEB3	A0JP26	581 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	GAS7	O60861	476 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	MED24	O75448	989 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	RHOBTB3	O94955	611 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	AR	P10275	920 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	OSBP	P22059	807 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	MCM6	Q14566	821 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	POTEB	Q6S5H4	581 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	CNMD	O75829	334 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	CCND2	P30279	289 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	COPB2	P35606	906 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ASIC1	P78348	528 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	PLCB2	Q00722	1185 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	WDR81	Q562E7	1941 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MEIS2-215	ENST00000559561	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		15.23	■□□□□ 0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms