RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 MYH4Q9Y623 1939 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CACNA1HO95180 2353 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 NFIBO00712 420 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PLA2G6O60733 806 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PRDM1O75626 825 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC96Q2M329 555 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SBK1Q52WX2 424 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PNMA2Q9UL42 364 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 MTMR7Q9Y216 660 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 NR2E1Q9Y466 385 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 FAM186AA6NE01 2351 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ARIH2O95376 493 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TDO2P48775 406 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 KAT2BQ92831 832 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 P2RX5Q93086 422 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 NEK1Q96PY6 1258 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 STX8Q9UNK0 236 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 F2P00734 622 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CTSHP09668 335 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF286BP0CG31 522 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 EDNRBP24530 442 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 UBE3CQ15386 1083 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 LY6KQ17RY6 165 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 FLCNQ8NFG4 579 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 WNT8BQ93098 351 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 HAUS7Q99871 368 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TLE6Q9H808 572 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CAND2O75155 1236 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 APPP05067 770 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM27P14373 513 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CLCN5P51795 746 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 RARSP54136 660 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ARHGAP1Q07960 439 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ANGPT1Q15389 498 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SERINC5Q86VE9 423 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 POF1BQ8WVV4 589 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 GLP2RO95838 553 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SDHBP21912 280 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TFAP4Q01664 338 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 LAMC2Q13753 1193 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PPTC7Q8NI37 304 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SUSD6Q92537 303 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 LCTP09848 1927 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.41□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 TRIOO75962 3097 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 HAS3O00219 553 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 BRD1O95696 1058 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ITGB1P05556 798 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 RFX1P22670 979 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 STXBP2Q15833 593 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SMAD3-211ENST00000559460 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa11.39□□□□□ -0.59
SMAD3-211ENST00000559460 TSPY2A6NKD2 308 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms