RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 ARVCFO00192 962 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 KCNA2P16389 499 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 NAPAP54920 295 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 FGD1P98174 961 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 TTLL4Q14679 1199 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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RABGGTA-207ENST00000558936 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-207ENST00000558936 TET1Q8NFU7 2136 aa14.53□□□□□ -0.08
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RABGGTA-207ENST00000558936 FAM86B1E9PN63 330 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 HAS3O00219 553 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 B4GALT4O60513 344 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 ARP10275 920 aa14.52□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAF1Q13077 416 aa14.52□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 TOX2Q96NM4 488 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.52□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 SPC25Q9HBM1 224 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 B4DLN1 442 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 KIAA0355O15063 1070 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 JAK2O60674 1132 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 GGPS1O95749 300 aa14.51□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 MYL3P08590 195 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 GPNMBQ14956 572 aa14.51□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 UIMC1Q96RL1 719 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 SREBF1P36956 1147 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 OXER1Q8TDS5 423 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 BADQ92934 168 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 GTF3C6Q969F1 213 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 PCYT2Q99447 389 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.5□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM205CA6NFA0 338 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 MEIS1O00470 390 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 WNT7AO00755 349 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 CLTBP09497 229 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 ADCY7P51828 1080 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 GPR20Q99678 358 aa14.49□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 PTPRSQ13332 1948 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 SIP14410 1827 aa14.48□□□□□ -0.09
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RABGGTA-207ENST00000558936 F2P00734 622 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 CYP3A4P08684 503 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 TGFB3P10600 412 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 CYP2C9P11712 490 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 HOXC8P31273 242 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 CPT1AP50416 773 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 LAMC2Q13753 1193 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 TRIM50Q86XT4 487 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-207ENST00000558936 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
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