RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SH2D4AQ9H788 454 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 IL23AQ9NPF7 189 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.52□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 RAD21O60216 631 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 B4GALT4O60513 344 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CCL23P55773 120 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PSMC6P62333 389 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 NKX3-2P78367 333 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CPXCR1Q8N123 301 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PANK1Q8TE04 598 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SCLYQ96I15 445 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CCDC17Q96LX7 622 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 C5orf42Q9H799 3197 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.51□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 ATP2A1O14983 1001 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TTLL4Q14679 1199 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 RAB30Q15771 203 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 GNASQ5JWF2 1037 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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RD3L-201ENST00000557640 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 BCL11AQ9H165 835 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 HIPK3Q9H422 1215 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 GOPCQ9HD26 462 aa9.5□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.5□□□□□ -0.89
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RD3L-201ENST00000557640 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.5□□□□□ -0.89
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RD3L-201ENST00000557640 ADH1AP07327 375 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 RHOQP17081 205 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 COPB2P35606 906 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 RAB15P59190 212 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 KLRC3Q07444 240 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TLK2Q86UE8 772 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.49□□□□□ -0.89
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RD3L-201ENST00000557640 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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RD3L-201ENST00000557640 ACDQ96AP0 544 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 FAM122AQ96E09 287 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 DDX11Q96FC9 970 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 GMCL1Q96IK5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CERS4Q9HA82 394 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 TRIOO75962 3097 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.49□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PRDM1O75626 825 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 ZMYND10O75800 440 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CA3P07451 260 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 FURINP09958 794 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PTGIRP43119 386 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 SNAP25P60880 206 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 CEP95Q96GE4 821 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 HAUS7Q99871 368 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.48□□□□□ -0.89
RD3L-201ENST00000557640 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.48□□□□□ -0.89
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