RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557489.5

LRMP-220, Transcript of lymphoid restricted membrane protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRMP, Length 1,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMP-220ENST00000557489 CAVIN2O95810 425 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 TTLL1O95922 423 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 LIG1P18858 919 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 SMARCA1P28370 1054 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 RTP1P59025 263 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 GABPAQ06546 454 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 TRIM32Q13049 653 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 MTMR2Q13614 643 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 MOGSQ13724 837 aa7.13□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 SLC39A14Q15043 492 aa7.13□□□□□ -1.27
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LRMP-220ENST00000557489 GALNT17Q6IS24 598 aa7.13□□□□□ -1.27
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LRMP-220ENST00000557489 CLIC4Q9Y696 253 aa7.13□□□□□ -1.27
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LRMP-220ENST00000557489 GUCY1A2P33402 732 aa7.12□□□□□ -1.27
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LRMP-220ENST00000557489 HERVK_113Q902F9 699 aa7.11□□□□□ -1.27
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LRMP-220ENST00000557489 SDF4Q9BRK5 362 aa7.11□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 RBSNQ9H1K0 784 aa7.11□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 PICK1Q9NRD5 415 aa7.11□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.11□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.1□□□□□ -1.27
LRMP-220ENST00000557489 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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