RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXCL10P02778 98 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGFB3P10600 412 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTK7Q13308 1070 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.49■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TET1Q8NFU7 2136 aa22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCOR1O75376 2440 aa22.48■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPOPA6NHQ4 379 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBNO60934 754 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF15O94989 841 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR2MP0CAP2 368 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMP1P13497 986 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRM4Q14833 912 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGM5Q15124 567 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA33Q96N06 139 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYH6P13533 1939 aa22.47■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERICH2A1L162 156 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EFCAB14O75071 495 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GGPS1O95749 300 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF286BP0CG31 522 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCND2P30279 289 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOMER1Q86YM7 354 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIGSQ96S52 555 aa22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP21A2P08686 494 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SP2Q02086 613 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TFF2Q03403 129 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTH1RQ03431 593 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IKBKEQ14164 716 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAD9AQ99638 391 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COG5Q9UP83 839 aa22.45■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC45O75419 566 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TROAPQ12815 778 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRB10Q13322 594 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL31RAQ8NI17 732 aa22.44■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYTH3O43739 400 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJB5O95377 273 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB103AP81534 67 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WTAPQ15007 396 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT40Q6A162 431 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCOA7Q8NI08 942 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP4K1Q92918 833 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCHNA4D1U4 455 aa22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SORBS3O60504 671 aa22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCTN1Q2MV58 587 aa22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERINC5Q86VE9 423 aa22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNT8BQ93098 351 aa22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SENP2Q9HC62 589 aa22.42■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EMSYQ7Z589 1322 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 E7EWF7 191 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BRB1 525 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LPXNO60711 386 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LGR5O75473 907 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAM2O75886 525 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIC1Q14526 733 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBTPS1Q14703 1052 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNPTABQ3T906 1256 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.41■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPH10BP0C881 870 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ICAM3P32942 547 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THPOP40225 353 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNQ1P51787 676 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF20Q5VTR2 975 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms