RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 SGSM3Q96HU1 749 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 GBP3Q9H0R5 595 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 GULP1Q9UBP9 304 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 PLAAQ9Y263 795 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 SUSD5O60279 629 aa7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ASMTLO95671 621 aa7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 FAM153BP0C7A2 387 aa7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 SLC7A5Q01650 507 aa7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 ADCY3O60266 1144 aa7.34□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ZBTB7AO95365 584 aa7.34□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ITGB3P05106 788 aa7.34□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.34□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.34□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 USP33Q8TEY7 942 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 PPM1BO75688 479 aa7.33□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 PAMP19021 973 aa7.33□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 ADAM17P78536 824 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.33□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 DDX11Q96FC9 970 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.33□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.33□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.32□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 RFPL3O75679 317 aa7.32□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.32□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 NPHS1O60500 1241 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 CYP2C8P10632 490 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 GRB10Q13322 594 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 NINJ1Q92982 152 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.31□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 C7orf72A4D263 438 aa7.3□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 AGRPO00253 132 aa7.3□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 FUCA1P04066 466 aa7.3□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 NAT2P11245 290 aa7.3□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 TM4SF20Q53R12 229 aa7.3□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.3□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 C8BP07358 591 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 APBA2Q99767 749 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQU0 124 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.28□□□□□ -1.24
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USP15-218ENST00000552346 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 NIM1KQ8IY84 436 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 MFSD3Q96ES6 412 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 LOXL4Q96JB6 756 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-218ENST00000552346 PLD2O14939 933 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PLATP00750 562 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TNFRSF1AP19438 455 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 THBS2P35442 1172 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 RGL3Q3MIN7 710 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SYT3Q9BQG1 590 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CLEC1BQ9P126 229 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 KCNQ2O43526 872 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CAPNS1P04632 268 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ZXDAP98168 799 aa7.26□□□□□ -1.25
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