RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	FIBP	O43427	364 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	GGPS1	O95749	300 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	PFKM	P08237	780 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	RBL2	Q08999	1139 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	NEDD9	Q14511	834 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137		Q7L0L9	218 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CS-223	ENST00000551137	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.21	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	NID2	Q14112	1375 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	MAFG	O15525	162 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	FGB	P02675	491 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CYP2C9	P11712	490 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PSMA5	P28066	241 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	RFC2	P35250	354 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PSEN2	P49810	448 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	BFSP2	Q13515	415 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3	7e-8	■■■□□ 18
CS-223	ENST00000551137	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ACR	P10323	421 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CDC27	P30260	824 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	HOXC8	P31273	242 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CCL23	P55773	120 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	MFSD10	Q14728	455 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PTGIS	Q16647	500 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137		Q6ZUG5	572 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	STXBP3	O00186	592 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CPA1	P15085	419 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	FGD1	P98174	961 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	BRF1	Q92994	677 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137		H3BRB1	525 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ITGB5	P18084	799 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3	6e-6	■■■□□ 15.4
CS-223	ENST00000551137	NAPA	P54920	295 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PTK7	Q13308	1070 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3

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