RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 IGHDP01880 384 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 TCTN1Q2MV58 587 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 ZNF618Q5T7W0 954 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 FAM117BQ6P1L5 589 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 RAD9AQ99638 391 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 EFCAB14O75071 495 aa19.75■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 KCNV1Q6PIU1 500 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 WNT8BQ93098 351 aa19.75■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 BDP1A6H8Y1 2624 aa19.74■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 ZBTB5O15062 677 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 GHRHRQ02643 423 aa19.74■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 VSIG10LQ86VR7 867 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 HOMER1Q86YM7 354 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 LGR5O75473 907 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 ERVK-21P61565 698 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 SEC23AQ15436 765 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 SAMD3Q8N6K7 520 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 MTMR8Q96EF0 704 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 MLXIPQ9HAP2 919 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 LINC01553A4QN01 128 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 POLR2MP0CAP2 368 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 THPOP40225 353 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 SP2Q02086 613 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 HIC1Q14526 733 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 MBTPS1Q14703 1052 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 FCHSD1Q86WN1 690 aa19.72■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.72■□□□□ 0.75
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CS-214ENST00000548849 RSPH10BP0C881 870 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 TGFB3P10600 412 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 CCND2P30279 289 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 TRDNQ13061 729 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 DBF4BQ8NFT6 615 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.757e-8■■■□□ 18
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CS-214ENST00000548849 IL25Q9H293 177 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 EMSYQ7Z589 1322 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-214ENST00000548849 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 AMHP03971 560 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 TRAF1Q13077 416 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SERINC5Q86VE9 423 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 MYOCDQ8IZQ8 938 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 ATP6V0A1Q93050 837 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 INSL6Q9Y581 213 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 H3BRB1 525 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 FAM122AQ96E09 287 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 ERICH2A1L162 156 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 NOP56O00567 594 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
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CS-214ENST00000548849 FBXO22Q8NEZ5 403 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 TREHO43280 583 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 LGALS2P05162 132 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 PLA2G5P39877 138 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 GNPTABQ3T906 1256 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 LRFN3Q9BTN0 628 aa19.67■□□□□ 0.74
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