RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 F2P00734 622 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 ICAM3P32942 547 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 KRT32Q14532 448 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PTGISQ16647 500 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 KCNB2Q92953 911 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 CUL5Q93034 780 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SPATA33Q96N06 139 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SCN5AQ14524 2016 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SORBS3O60504 671 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PFKMP08237 780 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 IQCF3P0C7M6 154 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF286BP0CG31 522 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PBX2P40425 430 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PSEN2P49810 448 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 GNPTABQ3T906 1256 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 TIFAQ96CG3 184 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PBX4Q9BYU1 374 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 NOD1Q9Y239 953 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 A0A0C4DFX4 3053 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBTB43O43298 467 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SEMA3FQ13275 785 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 BFSP2Q13515 415 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 MFSD10Q14728 455 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 C7orf31Q8N865 590 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 RETREG2Q8NC44 543 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 TET1Q8NFU7 2136 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 VCANP13611 3396 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 FIBPO43427 364 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 HSPA4P34932 840 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 RFC2P35250 354 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 FUT2Q10981 343 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 NEDD9Q14511 834 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 RTN1Q16799 776 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 CAGE1Q8TC20 777 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 ALG1Q9BT22 464 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF576Q9H609 170 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 MYO9BQ13459 2157 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAMENP-203ENST00000548391 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 CPA1P15085 419 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 RBL2Q08999 1139 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 HIC1Q14526 733 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 GRIN2CQ14957 1233 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 UBE2SQ16763 222 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 METTL7BQ6UX53 244 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 MYLIPQ8WY64 445 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 H3BRB1 525 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 CDC27P30260 824 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 RCAN1P53805 252 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 GPNMBQ14956 572 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 NLRX1Q86UT6 975 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC155Q8N6L0 562 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 USP26Q9BXU7 913 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 MSRAQ9UJ68 235 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 GOLGA8AA7E2F4 631 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBBXA8MT70 800 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 REC8O95072 547 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAMENP-203ENST00000548391 LGALS2P05162 132 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms