RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS6KB1P23443 525 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 RFC2P35250 354 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF76P36508 570 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ANTXR2P58335 489 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 PGM5Q15124 567 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 KATNBL1Q9H079 304 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 HIPK3Q9H422 1215 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 GPR37L1O60883 481 aa6.41□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.4□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 SCG2P13521 617 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ICAM3P32942 547 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP4BP1P59074 171 aa6.4□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAAP100Q0VG06 881 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR1Q13613 665 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SESTD1Q86VW0 696 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 AFG1LQ8WV93 481 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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