RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541335.1

KDM5A-208, Transcript of lysine demethylase 5A, human

TSL 2

Gene KDM5A, Length 378 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM5A-208	ENST00000541335	NKX3-2	P78367	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335		H7BY64	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	MATN3	O15232	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LCP1	P13796	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	KCNJ6	P48051	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	GFRA1	P56159	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LSAMP	Q13449	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	B4GALT3	O60512	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TADA3	O75528	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CAPNS1	P04632	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ZNF536	O15090	1300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	DDAH1	O94760	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LRG1	P02750	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	IL13	P35225	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ZXDA	P98168	799 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ETFB	P38117	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	FXN	Q16595	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	DGKI	O75912	1065 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	GRIA2	P42262	883 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	SURF1	Q15526	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KDM5A-208	ENST00000541335	CYP7B1	O75881	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	GJB6	O95452	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	TCF3	P15923	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	ICAM4	Q14773	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	CDSN	Q15517	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	EPN3	Q9H201	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM5A-208	ENST00000541335	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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