RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 ARMT1Q9H993 441 aa11.9□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.9□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.9□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.9□□□□□ -0.5
LMO3-215ENST00000537304 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.9□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PPIP5K2O43314 1243 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PAX7P23759 505 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ANXA13P27216 316 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CXCR5P32302 372 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 KIF5BP33176 963 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PDE4DQ08499 809 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ZNF844Q08AG5 666 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RRAGAQ7L523 313 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RAPGEF5Q92565 580 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 FAM212AQ96EL1 285 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 TSG101Q99816 390 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CEP72Q9P209 647 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.89□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 H0YGN5 161 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 DRD4P21917 467 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 GCKP35557 465 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ZNF131P52739 623 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RASSF7Q02833 373 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RPS6KA1Q15418 735 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R7Q15435 360 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 NPY5RQ15761 445 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 FAM228AQ86W67 206 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PROM2Q8N271 834 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 IFT74Q96LB3 600 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 NFS1Q9Y697 457 aa11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 LRRC53A6NM62 1247 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RAD51CO43502 376 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 NCK2O43639 380 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PALMO75781 387 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 FLOT1O75955 427 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ITGA6P23229 1130 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CCND1P24385 295 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 GBP1P32455 592 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ASIC1P78348 528 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ATP2B2Q01814 1243 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 E2F5Q15329 346 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 IL17AQ16552 155 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CENPPQ6IPU0 288 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 BLIDQ8IZY5 108 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 TEX9Q8N6V9 391 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 MTMR8Q96EF0 704 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SAAL1Q96ER3 474 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PSMB7Q99436 277 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PAPPAQ13219 1627 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 KLHL33A6NCF5 533 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CYP27B1O15528 508 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SART1O43290 800 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 GNA14O95837 355 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 PHKA1P46020 1223 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 KLK7P49862 253 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CTSWP56202 376 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 SCFD2Q8WU76 684 aa11.87□□□□□ -0.51
LMO3-215ENST00000537304 BAP1Q92560 729 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms