RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 PTPRTO14522 1441 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 PEX10O60683 326 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 PEX14O75381 377 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 PAMP19021 973 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 DDR2Q16832 855 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 OLFML2BQ68BL8 750 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CEP152O94986 1710 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TONSLQ96HA7 1378 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 AGLP35573 1532 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 NUDT19A8MXV4 375 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 KIF3BO15066 747 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ITGAVP06756 1048 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 MSL3P1P0C860 447 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 C1QTNF9P0C862 333 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 RAB3GAP1Q15042 981 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC181Q5TID7 509 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 BICRALQ6AI39 1079 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 AGRPO00253 132 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ABLIM1O14639 778 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 KLF4O43474 513 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SEMA7AO75326 666 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TACR1P25103 407 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CORO7P57737 925 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-214ENST00000530727 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC1BQ9P126 229 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TRPM2O94759 1503 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 DBX1A6NMT0 343 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 HRKO00198 91 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 TBX1O43435 398 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 GLDCP23378 1020 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 VIPR1P32241 457 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-214ENST00000530727 EPN3Q9H201 632 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC3O15438 1527 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 KRT1P04264 644 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 PLS3P13797 630 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 RAB33AQ14088 237 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SLC10A6Q3KNW5 377 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SGPP1Q9BX95 441 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 KANK1Q14678 1352 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.46□□□□□ -1.53
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PTPRC-214ENST00000530727 THBDP07204 575 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 MED14OSP0DP75 135 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 DLG4P78352 724 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 CABP7Q86V35 215 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 GULP1Q9UBP9 304 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 CLTCL1P53675 1640 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 NPATQ14207 1427 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 NPHS1O60500 1241 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 HSD3B2P26439 372 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 HOXC12P31275 282 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 KCNJ6P48051 423 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-214ENST00000530727 NR1I3Q14994 352 aa5.46□□□□□ -1.54
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