RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.75■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 MARCH6O60337 910 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52Z1P0C646 297 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-208ENST00000524325 LBX1P52954 281 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-208ENST00000524325 SP2Q02086 613 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1-208ENST00000524325 SPECC1Q5M775 1068 aa25.74■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.73■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 RAET1EQ8TD07 263 aa25.73■■□□□ 1.71
TSNARE1-208ENST00000524325 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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TSNARE1-208ENST00000524325 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
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TSNARE1-208ENST00000524325 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
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TSNARE1-208ENST00000524325 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.69■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPV1Q8NER1 839 aa25.69■■□□□ 1.7
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TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.68■■□□□ 1.7
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TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD10O75832 226 aa25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 ICAM3P32942 547 aa25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM20AQ96MK3 541 aa25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1-208ENST00000524325 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.67■■□□□ 1.7
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