RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 Q6ZUG5 572 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 GBF1Q92538 1859 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATA33Q96N06 139 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 REC8O95072 547 aa28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 ALG1Q9BT22 464 aa28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.38■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TGFB3P10600 412 aa28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 FGD1P98174 961 aa28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 BRF1Q92994 677 aa28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 PSEN2P49810 448 aa28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 RASIP1Q5U651 963 aa28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 GUCD1Q96NT3 240 aa28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TET1Q8NFU7 2136 aa28.36■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 F2P00734 622 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 RPS6KB1P23443 525 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 ICAM3P32942 547 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 MFSD10Q14728 455 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTGISQ16647 500 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.35■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 HAS3O00219 553 aa28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 STAM2O75886 525 aa28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 GNPTABQ3T906 1256 aa28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 SESTD1Q86VW0 696 aa28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 STXBP3O00186 592 aa28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 HIC1Q14526 733 aa28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 HERVK_113Q902F9 699 aa28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
LAPTM4B-202ENST00000517924 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.33■■■□□ 2.13
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LAPTM4B-202ENST00000517924 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.33■■■□□ 2.13
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LAPTM4B-202ENST00000517924 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 FIBPO43427 364 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPFIA4O75335 1185 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 FGBP02675 491 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NAPAP54920 295 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PGBD1Q96JS3 809 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 USP26Q9BXU7 913 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NOD1Q9Y239 953 aa28.32■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ITGB5P18084 799 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 RCAN1P53805 252 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 C7orf31Q8N865 590 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.31■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPFIA3O75145 1194 aa28.3■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PBX2P40425 430 aa28.3■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 SP4Q02446 784 aa28.3■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 METTL7BQ6UX53 244 aa28.3■■■□□ 2.12
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LAPTM4B-202ENST00000517924 PITPNM1O00562 1244 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP9AO75110 1047 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 LGALS2P05162 132 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 IQCF3P0C7M6 154 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 DNAJB2P25686 324 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEDD9Q14511 834 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBXL16Q8N461 479 aa28.29■■■□□ 2.12
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM260Q9NX78 707 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 BARHL2Q9NY43 387 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.29■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NID2Q14112 1375 aa28.28■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADAMTS3O15072 1205 aa28.28■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PSMA5P28066 241 aa28.28■■■□□ 2.12
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