RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516123.1

SNORD116-28-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-28, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-28, Length 91 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-28-201ENST00000516123 LMF1Q96S06 567 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 DTLQ9NZJ0 730 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 MYO1BO43795 1136 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 EPHX1P07099 455 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 COMTP21964 271 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 GTF2A2P52657 109 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC7A5Q01650 507 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 IQCEQ6IPM2 695 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 POMZP3Q6PJE2 187 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 DPF3Q92784 378 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZG16BQ96DA0 208 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 FGD4Q96M96 766 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 CRBNQ96SW2 442 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF652Q9Y2D9 606 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 HGSO14964 777 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ADH4P08319 380 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 SCRN1Q12765 414 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TEPPQ6URK8 271 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 RUFY4Q6ZNE9 571 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 EDAQ92838 391 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 GNRHR2Q96P88 292 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 AKT3Q9Y243 479 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 NOP56O00567 594 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 FOXS1O43638 330 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 KCNH1O95259 989 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 CHGBP05060 677 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 NAT2P11245 290 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ERCC3P19447 782 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 FPR2P25090 351 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 MBLAC2Q68D91 279 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 CEP68Q76N32 757 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 COPS5Q92905 334 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 FAM89AQ96GI7 184 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM169Q96HH4 297 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 GPRC5CQ9NQ84 441 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 PPT2Q9UMR5 302 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 X6R8D5 127 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 MAFKO60675 156 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 FBXO21O94952 628 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 LMO1P25800 156 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 KCNAB2Q13303 367 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 STEAP3Q658P3 488 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 Q6ZUG5 572 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 Q8N1Y9 231 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TCRBV5S2A0A599 114 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 RAC3P60763 192 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 INF2Q27J81 1249 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 AGBL4Q5VU57 503 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 VASNQ6EMK4 673 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ERICH6Q7L0X2 663 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 OR6P1Q8NGX9 317 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 DIO2Q92813 273 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 EXTL1Q92935 676 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 NUDT11Q96G61 164 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRAIPQ9BWF2 469 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 EMC9Q9Y3B6 208 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 H7BY64 318 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 DGKIO75912 1065 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 RAD17O75943 681 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 KLHL18O94889 574 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 LRG1P02750 347 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 MAKP20794 623 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ACO1P21399 889 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 BCL6P41182 706 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD116-28-201ENST00000516123 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms