RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 STAM2O75886 525 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS20O76081 388 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN5AQ14524 2016 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 GBF1Q92538 1859 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP4K1Q92918 833 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CUL5Q93034 780 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CYTH3O43739 400 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 EFCAB14O75071 495 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RBL2Q08999 1139 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 IKBKEQ14164 716 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TMTC2Q8N394 836 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SENP2Q9HC62 589 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFRSF10AO00220 468 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 NEDD9Q14511 834 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 AAK1Q2M2I8 961 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 IL31RAQ8NI17 732 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K14Q99558 947 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 GNAQP50148 359 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SP2Q02086 613 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MTA3Q9BTC8 594 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC69A6NI79 296 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 H3BRB1 525 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RFXAPO00287 272 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 DDAH1O94760 285 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL10P02778 98 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SMARCA1P28370 1054 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TAP1Q03518 808 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 USP26Q9BXU7 913 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 NBNO60934 754 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 GNAT1P11488 350 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MCM5P33992 734 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 THPOP40225 353 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 EMSYQ7Z589 1322 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 FIBPO43427 364 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 PRC1O43663 620 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH10BP0C881 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CALM1P0DP23 149 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CALM2P0DP24 149 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CALM3P0DP25 149 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ICAM3P32942 547 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ANTXR2P58335 489 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 GPNMBQ14956 572 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRX1Q86UT6 975 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM87BQ96K49 555 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LGR5O75473 907 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 METTL7BQ6UX53 244 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD9AQ99638 391 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MYL10Q9BUA6 226 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LY9Q9HBG7 655 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LGALS2P05162 132 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB103AP81534 67 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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