RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502715.1

UBE2CP3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP3, Length 450 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP3-201ENST00000502715 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PMEPA1Q969W9 287 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 WDR18Q9BV38 432 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GINM1Q9NU53 330 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PARP2Q9UGN5 583 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CEP290O15078 2479 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MYPNQ86TC9 1320 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 A6NHS1 94 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GIPC1O14908 333 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SORBS3O60504 671 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PHACTR2O75167 634 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 HMMRO75330 724 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ASNSP08243 561 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CYP7A1P22680 504 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 HOXD10P28358 340 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GRK4P32298 578 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 HMGCS2P54868 508 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 FCGRTP55899 365 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 DAB2P98082 770 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRKCZQ05513 592 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MAP3K12Q12852 859 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SPP2Q13103 211 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ORC1Q13415 861 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PDE3AQ14432 1141 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TRIM22Q8IYM9 498 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 KCNB2Q92953 911 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SCYL1Q96KG9 808 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 BACH2Q9BYV9 841 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 EHD4Q9H223 541 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PALD1Q9ULE6 856 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 USP20Q9Y2K6 914 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ATAD5Q96QE3 1844 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 DOCK3Q8IZD9 2030 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 C19orf81C9J6K1 198 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GDF11O95390 407 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 HLA-DOAP06340 250 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 PDE6AP16499 860 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GNA15P30679 374 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 BACE1P56817 501 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 JAG1P78504 1218 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TNP2Q05952 138 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GABPAQ06546 454 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCINQ13939 588 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP3-201ENST00000502715 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms