RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM199Q8N511 208 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 KAT2BQ92831 832 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SPATA33Q96N06 139 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF286BP0CG31 522 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ICAM3P32942 547 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SEMA3FQ13275 785 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 GPR153Q6NV75 609 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 RUFY3Q7L099 469 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 STXBP3O00186 592 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 FIBPO43427 364 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 CYP2C9P11712 490 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 CCL23P55773 120 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 BARHL2Q9NY43 387 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 F2P00734 622 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ACRP10323 421 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PSEN2P49810 448 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ADCY7P51828 1080 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 NEDD9Q14511 834 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PPFIA4O75335 1185 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 EVCP57679 992 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 MFSD10Q14728 455 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM240Q5SV17 173 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 METTL7BQ6UX53 244 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 Q7L0L9 218 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 NLRX1Q86UT6 975 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SESTD1Q86VW0 696 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 GPRASP2Q96D09 838 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 ALG1Q9BT22 464 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 IL23AQ9NPF7 189 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 NOD1Q9Y239 953 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SMCO2A6NFE2 343 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 HAS3O00219 553 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SCG2P13521 617 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PTGISQ16647 500 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 DEFB123Q8N688 67 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PHKBQ93100 1093 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SCLYQ96I15 445 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 PGBD1Q96JS3 809 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD11-202ENST00000498438 SCN5AQ14524 2016 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 PPFIA3O75145 1194 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 ITGB5P18084 799 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 NTRK3Q16288 839 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF365Q70YC5 407 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 C7orf31Q8N865 590 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 ANO3Q9BYT9 981 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 LGALS2P05162 132 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 SP4Q02446 784 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 PKN1Q16512 942 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 CDHR1Q96JP9 859 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 GPR20Q99678 358 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-202ENST00000498438 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms