RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495174.5

SH3BP1-208, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 947 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-208ENST00000495174 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 NLRX1Q86UT6 975 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 PPTC7Q8NI37 304 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 PHKBQ93100 1093 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 GPRASP2Q96D09 838 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 C6orf50Q9HD87 102 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 CEP290O15078 2479 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 CDKL5O76039 1030 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 DEXIO95424 95 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 CD4P01730 458 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 UBE2SQ16763 222 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 BICD2Q8TD16 824 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 AFG1LQ8WV93 481 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 GRIN2DO15399 1336 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 PFKFB2O60825 505 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 PPFIA4O75335 1185 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 GGPS1O95749 300 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 RAG1P15918 1043 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 ANO3Q9BYT9 981 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 TBX21Q9UL17 535 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 NEK4P51957 841 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 AK2P54819 239 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SP2Q02086 613 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 STK3Q13188 491 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 METTL7BQ6UX53 244 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 IL27Q8NEV9 243 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 SPATA33Q96N06 139 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-208ENST00000495174 TIMP1P01033 207 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 SREBF1P36956 1147 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 PSMC6P62333 389 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 SCRN1Q12765 414 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 SEMA3FQ13275 785 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 SESTD1Q86VW0 696 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 JADE2Q9NQC1 790 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 STK36Q9NRP7 1315 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 KAT6AQ92794 2004 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 F2P00734 622 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 ITGB5P18084 799 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 MTMR1Q13613 665 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 GALNT17Q6IS24 598 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 TDHQ8IZJ6 230 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 BADQ92934 168 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 HAS3O00219 553 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 B4GALT4O60513 344 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 CYP3A4P08684 503 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 CEP55Q53EZ4 464 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 MFSD5Q6N075 450 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 KAT2BQ92831 832 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 KCNA2P16389 499 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 XBP1P17861 261 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 ITGB8P26012 769 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 NLRP5P59047 1200 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 ARHGAP4P98171 946 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 TMEM260Q9NX78 707 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1-208ENST00000495174 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms