RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MAST1Q9Y2H9 1570 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NOS1P29475 1434 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 PTPN23Q9H3S7 1636 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.66□□□□□ -1.66
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ANKRD28-211ENST00000492895 TACR1P25103 407 aa4.66□□□□□ -1.66
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ANKRD28-211ENST00000492895 RPTNQ6XPR3 784 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CPNE8Q86YQ8 564 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 C1QL4Q86Z23 238 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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ANKRD28-211ENST00000492895 LGR4Q9BXB1 951 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CYP26B1Q9NR63 512 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa4.65□□□□□ -1.66
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ANKRD28-211ENST00000492895 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.65□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 N4BP3O15049 544 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 SUSD5O60279 629 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 GJB6O95452 261 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CYBBP04839 570 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGAVP06756 1048 aa4.65□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 MAPKAPK2P49137 400 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 SCRN1Q12765 414 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.65□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 TMC6Q7Z403 805 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CLEC1BQ9P126 229 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 SLIT1O75093 1534 aa4.65□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 C7orf72A4D263 438 aa4.64□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 PLS3P13797 630 aa4.64□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 EPHB3P54753 998 aa4.64□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 ST7Q9NRC1 585 aa4.64□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 KCTD3Q9Y597 815 aa4.64□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 IRAK3Q9Y616 596 aa4.64□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 ROCK1Q13464 1354 aa4.64□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGRL2O95490 1459 aa4.63□□□□□ -1.67
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ANKRD28-211ENST00000492895 TBX1O43435 398 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 KLF4O43474 513 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 THBDP07204 575 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 GLI4P10075 376 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 YY1P25490 414 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXC12P31275 282 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CYP4F3Q08477 520 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 SSPNQ14714 243 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 RGL3Q3MIN7 710 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF385BQ569K4 471 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 BRINP3Q76B58 766 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 LZTR1Q8N653 840 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD28-211ENST00000492895 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.63□□□□□ -1.67
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