RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	LRG1	P02750	347 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	VAMP1	P23763	118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	BCL11A	Q9H165	835 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	FZD7	O75084	574 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	RECK	O95980	971 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	NKX3-2	P78367	333 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	VHLL	Q6RSH7	139 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CEP68	Q76N32	757 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	APBA2	Q99767	749 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PTPN18	Q99952	460 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	BCL6	P41182	706 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2A2	P52657	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	VPS11	Q9H270	941 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952		H7BY64	318 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SELENOP	P49908	381 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952		Q8TCH9	128 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	LGR4	Q9BXB1	951 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	TBX1	O43435	398 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	AMH	P03971	560 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	HOXC12	P31275	282 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	KCNAB2	Q13303	367 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	C1orf159	Q96HA4	380 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM209	Q96SK2	561 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF623	O75123	536 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CYP7B1	O75881	506 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	KLHL18	O94889	574 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NCAPH	Q15003	741 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PPP2R5E	Q16537	467 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	DIO2	Q92813	273 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM169	Q96HH4	297 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	WRNIP1	Q96S55	665 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	BTG4	Q9NY30	223 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NAT2	P11245	290 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	KLF10	Q13118	480 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CHRNA2	Q15822	529 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	MUSK	O15146	869 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CHGB	P05060	677 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ITGAV	P06756	1048 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	LCP1	P13796	627 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	GFRA1	P56159	465 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	LSAMP	Q13449	338 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	STEAP3	Q658P3	488 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.11	□□□□□ -1.59

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