RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL10	Q9BUA6	226 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FIBP	O43427	364 aa		19.87	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		19.87	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRX1	Q86UT6	975 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	IL31RA	Q8NI17	732 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA33	Q96N06	139 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		19.86	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB43	O43298	467 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	GGPS1	O95749	300 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PSEN2	P49810	448 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB30	Q15771	203 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGIS	Q16647	500 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL7B	Q6UX53	244 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf31	Q8N865	590 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRASP2	Q96D09	838 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCD1	Q96NT3	240 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	NOD1	Q9Y239	953 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	COL6A3	P12111	3177 aa		19.85	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2C9	P11712	490 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTN1	P12814	892 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB2	P25686	324 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL23	P55773	120 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ANAPC15	P60006	121 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SP2	Q02086	613 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT2	Q10981	343 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PTK7	Q13308	1070 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MCTP2	Q6DN12	878 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MICU3	Q86XE3	530 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO9B	Q13459	2157 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		19.84	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCF3	P0C7M6	154 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ACR	P10323	421 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD10	Q14728	455 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	RTN1	Q16799	776 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	VWCE	Q96DN2	955 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		19.83	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXC8	P31273	242 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	MSRA	Q9UJ68	235 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GBF1	Q92538	1859 aa		19.82	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BRB1	525 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	BAIAP3	O94812	1187 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SELP	P16109	830 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	RXRA	P19793	462 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6KB1	P23443	525 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	EVC	P57679	992 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	RUFY3	Q7L099	469 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TIFA	Q96CG3	184 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	BARHL2	Q9NY43	387 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	NID2	Q14112	1375 aa		19.81	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CAND2	O75155	1236 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA3F	Q13275	785 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf34	Q49A92	452 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SCLY	Q96I15	445 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PBX4	Q9BYU1	374 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF576	Q9H609	170 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76

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