RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489359.1

LIPA-208, Transcript of lipase A, lysosomal acid type, human

TSL 2

Gene LIPA, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIPA-208	ENST00000489359	LSAMP	Q13449	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	GML	Q99445	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIPA-208	ENST00000489359	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CP	P00450	1065 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	SLC6A11	P48066	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CAP1	Q01518	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TESK1	Q15569	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	NTM	Q9P121	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TADA3	O75528	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	LRG1	P02750	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CELA3B	P08861	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	RAB33A	Q14088	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	KY	Q8NBH2	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359		H7BY64	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GJA9	P57773	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	PLP2	Q04941	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	AGRP	O00253	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GGN	Q86UU5	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	KCNK3	O14649	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	ADCY3	O60266	1144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	DGKI	O75912	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GRK2	P25098	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GRK3	P35626	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GTF2A2	P52657	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	EPN3	Q9H201	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359		E9PSI1	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	FGFR1	P11362	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	ZNF28	P17035	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	GLRB	P48167	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	NKX3-2	P78367	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	TUSC3	Q13454	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIPA-208	ENST00000489359	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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