RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 IQCF3P0C7M6 154 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF286BP0CG31 522 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 NKX3-2P78367 333 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TRDNQ13061 729 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 IKBKEQ14164 716 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 LY6KQ17RY6 165 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 FBXO11Q86XK2 927 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 PNMA1Q8ND90 353 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TTC14Q96N46 770 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 UIMC1Q96RL1 719 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 PARP14Q460N5 1801 aa6.29□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 A6NJR5 290 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 HIP1O00291 1037 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 KDM4AO75164 1064 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 AMHP03971 560 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 THPOP40225 353 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 PDE1AP54750 535 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TRAF1Q13077 416 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 ALX1Q15699 326 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 PTPROQ16827 1216 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 HOMER1Q86YM7 354 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 MORC4Q8TE76 937 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 SPATA33Q96N06 139 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 IWS1Q96ST2 819 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 YME1L1Q96TA2 773 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 KRT23Q9C075 422 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 LNPKQ9C0E8 428 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
AC004889.1-208ENST00000489077 ZMYM6O95789 1325 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 NEDD4P46934 1319 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 EMSYQ7Z589 1322 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CSPG5O95196 566 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 ARIH2O95376 493 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 KCNA5P22460 613 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PLA2G5P39877 138 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 NT5C2P49902 561 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TAP1Q03518 808 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GRB10Q13322 594 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 LAMC2Q13753 1193 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GNPTABQ3T906 1256 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 KRT40Q6A162 431 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 DGKHQ86XP1 1220 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PPTC7Q8NI37 304 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RAD9AQ99638 391 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 AMNQ9BXJ7 453 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CPVLQ9H3G5 476 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM50BQ9Y247 325 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 MCM3APO60318 1980 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.27□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.26□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms