RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 AURKAO14965 403 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 N4BP3O15049 544 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 L1CAMP32004 1257 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 SEPHS1P49903 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CDR1P51861 262 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 NR1I3Q14994 352 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 MZB1Q8WU39 189 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 RELTQ969Z4 430 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PPLO60437 1756 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 NAT2P11245 290 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CORO7P57737 925 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 GRB10Q13322 594 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 VPS37DQ86XT2 251 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 AKT3Q9Y243 479 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 EID1Q9Y6B2 187 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 IFT172Q9UG01 1749 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 DBHP09172 617 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 TCF3P15923 654 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 STK26Q9P289 416 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZFYVE9O95405 1425 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SRGAP3O43295 1099 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CYBBP04839 570 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 HOXA5P20719 270 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 MAPKAPK2P49137 400 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NCKAP1LP55160 1127 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CABP7Q86V35 215 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 LDHDQ86WU2 507 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PANK1Q8TE04 598 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 APBA2Q99767 749 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 E9PSI1 815 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH1O95259 989 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PAMP19021 973 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NCAPHQ15003 741 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 TNNI3KQ59H18 835 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SLIT1O75093 1534 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 MYOM2P54296 1465 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 F8W031 263 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PFKLP17858 780 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 BMP7P18075 431 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 BVESQ8NE79 360 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms