RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 TEX33O43247 280 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 POTEIP0CG38 1075 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 HMGCS2P54868 508 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 GHRHRQ02643 423 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 POTEGQ6S5H5 508 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 CEP55Q53EZ4 464 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 TTI2Q6NXR4 508 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 ATG4CQ96DT6 458 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 C12orf42Q96LP6 360 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 VWA5AO00534 786 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PLA2G4BP0C869 781 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 KRT31Q15323 416 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 12
USP13-202ENST00000482333 ERMNQ8TAM6 284 aa24.31■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 RPTORQ8N122 1335 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 EML1O00423 815 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 ZBED4O75132 1171 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 IDEP14735 1019 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 RPA1P27694 616 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 EHHADHQ08426 723 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SLC5A5Q92911 643 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 KCNJ18B7U540 433 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 MEIS1O00470 390 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 KCNJ12Q14500 433 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 P2RX5Q93086 422 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 C19orf81C9J6K1 198 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PSMD10O75832 226 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 CCNE1P24864 410 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PSMC6P62333 389 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 IL31RAQ8NI17 732 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 TRIM47Q96LD4 638 aa24.29■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 ADM5C9JUS6 153 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 ARP10275 920 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PBX1P40424 430 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SLC12A3P55017 1021 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SPAG1Q07617 926 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 GPBP1Q86WP2 473 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 STK24Q9Y6E0 443 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 FDX1P10109 184 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 CYP11B2P19099 503 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PPP1R2P41236 205 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 CYP4A11Q02928 519 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 REPS2Q8NFH8 660 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 THAP9Q9H5L6 903 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.27■■□□□ 1.48
USP13-202ENST00000482333 ITGB5P18084 799 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 COASYQ13057 564 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 PPP2R5CQ13362 524 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 ARSHQ5FYA8 562 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 RGL1Q9NZL6 768 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 RIPK3Q9Y572 518 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.26■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 BICDL2A1A5D9 508 aa24.25■■□□□ 1.47
USP13-202ENST00000482333 DSG3P32926 999 aa24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms