RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MEA1Q16626 185 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 LENG9Q96B70 501 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 NDST4Q9H3R1 872 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTEFA5A3E0 1075 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PSMD14O00487 310 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTEIP0CG38 1075 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MMP14P50281 582 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CLCN6P51797 869 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ZBED6P86452 979 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTEGQ6S5H5 508 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ACER1Q8TDN7 264 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 OGFRQ9NZT2 677 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TFR2Q9UP52 801 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SREBF1P36956 1147 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 Q4G0T1 1027 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 GPBP1Q86WP2 473 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CTAGE9A4FU28 777 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CYP11B2P19099 503 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 HERVK_113P62684 666 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 DLGAP5Q15398 846 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MAN2A1Q16706 1144 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FIGNQ5HY92 759 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TTLL6Q8N841 843 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 GMLQ99445 158 aa14.9□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 COL4A5P29400 1685 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 EPHB6O15197 1021 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 STAT2P52630 851 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TEX35Q5T0J7 233 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 MCTP2Q6DN12 878 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FAM151AQ8WW52 585 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TSG101Q99816 390 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CDC23Q9UJX2 597 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CNTNAP1P78357 1384 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 A0A1W2PQJ5 194 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TBX3O15119 743 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SLC12A3P55017 1021 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ARSHQ5FYA8 562 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ABCB11O95342 1321 aa14.89□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 MEIS1O00470 390 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PSMC6P62333 389 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 OGFOD1Q8N543 542 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 VEZTQ9HBM0 779 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TMX2Q9Y320 296 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 MSH4O15457 936 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CIITAP33076 1130 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PSMD1Q99460 953 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.88□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TRAF5O00463 557 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SLC26A4O43511 780 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms