RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 MTMR6Q9Y217 621 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ELP1O95163 1332 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 LARGE1O95461 756 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ICAM1P05362 532 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FDX1P10109 184 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CPA1P15085 419 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DNAJB2P25686 324 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TNFAIP2Q03169 654 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZNF543Q08ER8 600 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TKFCQ3LXA3 575 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 HS1BP3Q53T59 392 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ATL3Q6DD88 541 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PNMA1Q8ND90 353 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.19□□□□□ -1.26
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MITF-215ENST00000478490 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 REV3LO60673 3130 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PPC1 479 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PFKFB2O60825 505 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ASGR1P07306 291 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SMPD1P17405 629 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SNX17Q15036 470 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SHHQ15465 462 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GNASQ5JWF2 1037 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 Q6ZUG5 572 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CHST3Q7LGC8 479 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TBC1D5Q92609 795 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FAM161BQ96MY7 647 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 MTRQ99707 1265 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KAT14Q9H8E8 782 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SENP2Q9HC62 589 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KAT6AQ92794 2004 aa7.18□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TNKSO95271 1327 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ASB14A6NK59 587 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CTAGE5O15320 804 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CLTBP09497 229 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 EPHB4P54760 987 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 EVCP57679 992 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GJA9P57773 515 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PSMC6P62333 389 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FAAP100Q0VG06 881 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ST3GAL1Q11201 340 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 UVSSAQ2YD98 709 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TAPT1Q6NXT6 567 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 IQCA1Q86XH1 822 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DEFB123Q8N688 67 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TSPY26PQ9H489 355 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SPC25Q9HBM1 224 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TET1Q8NFU7 2136 aa7.17□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 E7EWF7 191 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 H3BQV1 296 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SNHG28P0DPA3 235 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RAG1P15918 1043 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 MCM5P33992 734 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TRDNQ13061 729 aa7.16□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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