RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 VWCEQ96DN2 955 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PITPNM1O00562 1244 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GGPS1O95749 300 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 RPS6KB1P23443 525 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PSMA5P28066 241 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CDC27P30260 824 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 Q6ZUG5 572 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CPA1P15085 419 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 NEDD9Q14511 834 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 FAM47CQ5HY64 1035 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 HERVK_113Q902F9 699 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 SPATA33Q96N06 139 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 USP26Q9BXU7 913 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CYP2C9P11712 490 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 RBL2Q08999 1139 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 METTL7BQ6UX53 244 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF365Q70YC5 407 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 Q7L0L9 218 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM265A0A087WTH1 108 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PFKMP08237 780 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PSEN2P49810 448 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 BRF1Q92994 677 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GPRASP2Q96D09 838 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 BARHL2Q9NY43 387 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CCL23P55773 120 aa26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 APOBRQ0VD83 1088 aa26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 COL6A3P12111 3177 aa26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 STXBP3O00186 592 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 ACRP10323 421 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 RFC2P35250 354 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 FGD1P98174 961 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 BFSP2Q13515 415 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 MFSD10Q14728 455 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PTGISQ16647 500 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 NLRX1Q86UT6 975 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CAGE1Q8TC20 777 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 CDHR1Q96JP9 859 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.89■■□□□ 1.9
C9orf3-215ENST00000478473 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 MAFGO15525 162 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 FGBP02675 491 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 ITGB5P18084 799 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 HOXC8P31273 242 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 UBE2SQ16763 222 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 RUFY3Q7L099 469 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.88■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF286BP0CG31 522 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 NAPAP54920 295 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 NTRK3Q16288 839 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 C7orf31Q8N865 590 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 SCLYQ96I15 445 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 GPR20Q99678 358 aa26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 ESYT2A0FGR8 921 aa26.86■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 IQCF3P0C7M6 154 aa26.86■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.86■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 GUCD1Q96NT3 240 aa26.86■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
C9orf3-215ENST00000478473 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms