RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476467.1

PSMB4-204, Transcript of proteasome subunit beta 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSMB4, Length 2,067 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4-204ENST00000476467 PTPAQ15257 358 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 PRR16Q569H4 304 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 RNF214Q8ND24 703 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 GABRQQ9UN88 632 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 MEIS1O00470 390 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 ITGB5P18084 799 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 PRKCZQ05513 592 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 STK38Q15208 465 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 ARMCX2Q7L311 632 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 POTEDQ86YR6 584 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 LENG9Q96B70 501 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 JADE2Q9NQC1 790 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 SRRDQ9UH36 339 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 LAD1O00515 517 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 FLT3LGP49771 235 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 PTGDRQ13258 359 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 SLC39A14Q15043 492 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 GNPTABQ3T906 1256 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 NLRX1Q86UT6 975 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 GPRASP2Q96D09 838 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 SPATA32Q96LK8 384 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 TINF2Q9BSI4 451 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 PCNTO95613 3336 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMB4-204ENST00000476467 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 HS1BP3Q53T59 392 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.96□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TBX3O15119 743 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 RGS20O76081 388 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 OR52Z1P0C646 297 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 IRF5Q13568 498 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MTMR1Q13613 665 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CALCRLQ16602 461 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CDHR1Q96JP9 859 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SPTLC2O15270 562 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PRPHP41219 470 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PRMT2P55345 433 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CCL14Q16627 93 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MTMR9Q96QG7 549 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 VTA1Q9NP79 307 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MSH4O15457 936 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MAFGO15525 162 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PPP6R2O75170 966 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 IGHA2P01877 340 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ARP10275 920 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ICAM3P32942 547 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FAM20AQ96MK3 541 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SEMA3FQ13275 785 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 UVSSAQ2YD98 709 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 HAS1Q92839 578 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FOXN1O15353 648 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MARCH6O60337 910 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SLC5A5Q92911 643 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FERMT2Q96AC1 680 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KATNBL1Q9H079 304 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TRIB2Q92519 343 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms