RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472491.1

NOM1-204, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene NOM1, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-204ENST00000472491 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.55■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 MMP3P08254 477 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 ICAM3P32942 547 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 NLRP5P59047 1200 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 ITGA7Q13683 1181 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 NEDD9Q14511 834 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 CDHR1Q96JP9 859 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 PGBD1Q96JS3 809 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 SPATA33Q96N06 139 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.54■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 SORBS3O60504 671 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 SP2Q02086 613 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 DGKDQ16760 1214 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 ME3Q16798 604 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 NECAB1Q8N987 351 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 PPTC7Q8NI37 304 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 GPRASP2Q96D09 838 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 TOX2Q96NM4 488 aa20.53■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 CLTBP09497 229 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 XBP1P17861 261 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 ZNF76P36508 570 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 CDK7P50613 346 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 PSMC6P62333 389 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 MTMR1Q13613 665 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 GTF3C6Q969F1 213 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.52■□□□□ 0.88
NOM1-204ENST00000472491 STK36Q9NRP7 1315 aa20.52■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SREBF1P36956 1147 aa20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 CHMP4BP1P59074 171 aa20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 WASF1Q92558 559 aa20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 KIF2CQ99661 725 aa20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.51■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 MAFGO15525 162 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 LARGE1O95461 756 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ITGB5P18084 799 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SEMA3FQ13275 785 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 RABEP1Q15276 862 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 JADE2Q9NQC1 790 aa20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 PPFIA4O75335 1185 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ARHGAP4P98171 946 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 FAAP100Q0VG06 881 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 METTL7BQ6UX53 244 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 AIFM3Q96NN9 605 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 GRIN2DO15399 1336 aa20.49■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ST18O60284 1047 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 CTDNEP1O95476 244 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 RAG1P15918 1043 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 CEP55Q53EZ4 464 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 GALNT17Q6IS24 598 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.48■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 KIAA0355O15063 1070 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ADAMTS3O15072 1205 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ZNF286BP0CG31 522 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SP4Q02446 784 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 BLIDQ8IZY5 108 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 IL27Q8NEV9 243 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 ALG1Q9BT22 464 aa20.47■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 DTNBO60941 627 aa20.46■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 CYP3A4P08684 503 aa20.46■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.46■□□□□ 0.87
NOM1-204ENST00000472491 KCNA2P16389 499 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms