RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, human

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRT-208	ENST00000469602	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRRT-208	ENST00000469602	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRRT-208	ENST00000469602	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	FIBP	O43427	364 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	PFKFB2	O60825	505 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CDKL5	O76039	1030 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	GGPS1	O95749	300 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CLTB	P09497	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ITGB5	P18084	799 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	PSMC6	P62333	389 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	FAAP100	Q0VG06	881 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	AP3B2	Q13367	1082 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	C6orf50	Q9HD87	102 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	KIAA0355	O15063	1070 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SORBS3	O60504	671 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	DEXI	O95424	95 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	GNA11	P29992	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NEDD9	Q14511	834 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	DGKD	Q16760	1214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	PGBD1	Q96JS3	809 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SPATA33	Q96N06	139 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	GDF15	Q99988	308 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ANO3	Q9BYT9	981 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TMEM260	Q9NX78	707 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CD4	P01730	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	BMP8B	P34820	402 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	SREBF1	P36956	1147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MTMR1	Q13613	665 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ME3	Q16798	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	METTL7B	Q6UX53	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	KIF2C	Q99661	725 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602		A0A1W2PPC1	479 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	LARGE1	O95461	756 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	KCNA2	P16389	499 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NLRP5	P59047	1200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	KAT2B	Q92831	832 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MEIS1	O00470	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	MAFG	O15525	162 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	B4GALT4	O60513	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SRRT-208	ENST00000469602	ATP9A	O75110	1047 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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