RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 STEAP3Q658P3 488 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 NBPF4Q96M43 638 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 MIB1Q86YT6 1006 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 DCAF4Q8WV16 495 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 EXOC2Q96KP1 924 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 C20orf173Q96LM9 149 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNJ15Q99712 375 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SNTG2Q9NY99 539 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 TADA3O75528 432 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 COL6A2P12110 1019 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CR1LQ2VPA4 569 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 LBX2Q6XYB7 198 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CDC6Q99741 560 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA25Q9BR10 227 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 DGKIO75912 1065 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP2C8P10632 490 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 SLURP1P55000 103 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 STYK1Q6J9G0 422 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ARMC5Q96C12 935 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-206ENST00000467748 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC27A2O14975 620 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 GRK2P25098 689 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 GRK3P35626 688 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 EMC4Q5J8M3 183 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LIPIQ6XZB0 460 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJC7Q99615 494 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 IPPKQ9H8X2 491 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 MYOTQ9UBF9 498 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 WASF3Q9UPY6 502 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LTFP02788 710 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SOD2P04179 222 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ITGA1P56199 1179 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR85P60893 370 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 GRIN1Q05586 938 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SASH1O94885 1247 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LRG1P02750 347 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 CAP1Q01518 475 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 CHRNA2Q15822 529 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 KIZQ2M2Z5 673 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 DTLQ9NZJ0 730 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3D21A4FU49 640 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNC1P48547 511 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 CTSWP56202 376 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM9Q13443 819 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF19Q5T6S3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 TEPPQ6URK8 271 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 CARFQ8N187 725 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms