RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 STK3Q13188 491 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 AP3B2Q13367 1082 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 DGKDQ16760 1214 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 NLRX1Q86UT6 975 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 PRO3102Q9H379 93 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf50Q9HD87 102 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA0355O15063 1070 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 GGPS1O95749 300 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 GNA11P29992 359 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMC6P62333 389 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 FAAP100Q0VG06 881 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NEDD9Q14511 834 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PKN1Q16512 942 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 C8orf34Q49A92 452 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MCTP2Q6DN12 878 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PPTC7Q8NI37 304 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CDHR1Q96JP9 859 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 ANO3Q9BYT9 981 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CDKL5O76039 1030 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NEK4P51957 841 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 AK2P54819 239 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 BICD2Q8TD16 824 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 GPRASP2Q96D09 838 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA33Q96N06 139 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 GRIN2DO15399 1336 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PPFIA3O75145 1194 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 DEXIO95424 95 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SP2Q02086 613 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TBX21Q9UL17 535 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SZT2Q5T011 3432 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MAFGO15525 162 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SORBS3O60504 671 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PFKFB2O60825 505 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PPFIA4O75335 1185 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CD4P01730 458 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR1Q13613 665 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 METTL7BQ6UX53 244 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 BADQ92934 168 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TIMP1P01033 207 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SREBF1P36956 1147 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CHMP4BP1P59074 171 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SCRN1Q12765 414 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SEMA3FQ13275 785 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TDHQ8IZJ6 230 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 PGBD1Q96JS3 809 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 JADE2Q9NQC1 790 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM260Q9NX78 707 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 B4GALT4O60513 344 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGB5P18084 799 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF76P36508 570 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NLRP5P59047 1200 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 F2P00734 622 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF286BP0CG31 522 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGB8P26012 769 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 PSEN2P49810 448 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGAP4P98171 946 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 FPGSQ05932 587 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms