RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936	EYA3	Q99504	573 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936	KRT82	Q9NSB4	513 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936		U3KQE9	123 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CEP170-209	ENST00000464936	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936		A0A0C4DFX4	3053 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ECE2	O60344	883 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO24	O75426	580 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PAPLN	O95428	1278 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ARNT	P27540	789 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TCIRG1	Q13488	830 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PWP1	Q13610	501 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SV2B	Q7L1I2	683 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	VPS37D	Q86XT2	251 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ARMC5	Q96C12	935 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF124	Q15973	351 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PPM1J	Q5JR12	505 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PDZD3	Q86UT5	571 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TRIM17	Q9Y577	477 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	CEACAM5	P06731	702 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	FUT4	P22083	530 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	NME2	P22392	152 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ARID5A	Q03989	594 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PRKCQ	Q04759	706 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MOB2	Q70IA6	237 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	FAM168A	Q92567	244 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	VAV3	Q9UKW4	847 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	UFL1	O94874	794 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ATP2B1	P20020	1258 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TM4SF4	P48230	202 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	OXCT1	P55809	520 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	GPSM2	P81274	684 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PAK2	Q13177	524 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	IKZF1	Q13422	519 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	NLRP10	Q86W26	655 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RNF214	Q8ND24	703 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	POLL	Q9UGP5	575 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RTL9	Q8NET4	1388 aa		5.8	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms