RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462219.5

LINC00879-201, long intergenic non-protein coding RNA 879, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00879, Length 695 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00879-201ENST00000462219 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 XBP1P17861 261 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CUL4AQ13619 759 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 KCNA10Q16322 511 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 KRT40Q6A162 431 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TNFRSF25Q93038 417 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 GPRASP2Q96D09 838 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 JADE2Q9NQC1 790 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 PHF24Q9UPV7 400 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 A6NJR5 290 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 KBTBD13C9JR72 458 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FAM86B1E9PN63 330 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MEIS1O00470 390 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FIBPO43427 364 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 ATP9AO75110 1047 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GH1P01241 217 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MMP1P03956 469 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 ACLYP53396 1101 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GNPTABQ3T906 1256 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GNASQ5JWF2 1037 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 NLRX1Q86UT6 975 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SPC25Q9HBM1 224 aa14.83□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MAFGO15525 162 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 ASGR1P07306 291 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 ARP10275 920 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 KCNA2P16389 499 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CIITAP33076 1130 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FOSBP53539 338 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 NR5A1Q13285 461 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CEP55Q53EZ4 464 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 TBCKQ8TEA7 893 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SNX21Q969T3 373 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FERMT2Q96AC1 680 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 WDR81Q562E7 1941 aa14.82□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 A0A1W2PQY0 241 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 BTBD18B2RXH4 712 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GGPS1O95749 300 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 USP11P51784 963 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GUCY1B3Q02153 619 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MTMR1Q13613 665 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 LAMC2Q13753 1193 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 AFG1LQ8WV93 481 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.81□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FAM205CA6NFA0 338 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SORBS3O60504 671 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GJB2P29033 226 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 KRT2P35908 639 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CPT1AP50416 773 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 NEDD9Q14511 834 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 LENG9Q96B70 501 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CDHR1Q96JP9 859 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 C8orf76Q96K31 380 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 GRIN2DO15399 1336 aa14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 MMP3P08254 477 aa14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 CYP3A7P24462 503 aa14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 ZNF76P36508 570 aa14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LINC00879-201ENST00000462219 TRIM29Q14134 588 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms