RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA33Q96N06 139 aa23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 CDKL5O76039 1030 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 RGS20O76081 388 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 GNA11P29992 359 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 BMP8BP34820 402 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 CDK7P50613 346 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 FAAP100Q0VG06 881 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 NEDD9Q14511 834 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PPTC7Q8NI37 304 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 BADQ92934 168 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 CDHR1Q96JP9 859 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.46■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.45■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 KAT6AQ92794 2004 aa23.45■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1W2PPC1 479 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SEC24BO95487 1268 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF76P36508 570 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 AP3B2Q13367 1082 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 BICD2Q8TD16 824 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 NOD1Q9Y239 953 aa23.45■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA0355O15063 1070 aa23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 NEK4P51957 841 aa23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 PGBD1Q96JS3 809 aa23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 ANO3Q9BYT9 981 aa23.44■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 ICAM3P32942 547 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 AK2P54819 239 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR1Q13613 665 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 NTRK3Q16288 839 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 MCTP2Q6DN12 878 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 GPRASP2Q96D09 838 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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SCAF8-204ENST00000461219 ESYT2A0FGR8 921 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 DEXIO95424 95 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 NLRP5P59047 1200 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SP2Q02086 613 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SP4Q02446 784 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 PKN1Q16512 942 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TDHQ8IZJ6 230 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 ALG1Q9BT22 464 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 GRIN2DO15399 1336 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 B4GALT4O60513 344 aa23.41■■□□□ 1.34
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SCAF8-204ENST00000461219 ZNF286BP0CG31 522 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 FPGSQ05932 587 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 C8orf34Q49A92 452 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.41■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 PPFIA4O75335 1185 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 METTL7BQ6UX53 244 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM199Q8N511 208 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 C7orf31Q8N865 590 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 PRO3102Q9H379 93 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 HIPK3Q9H422 1215 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.4■■□□□ 1.34
SCAF8-204ENST00000461219 TBX21Q9UL17 535 aa23.4■■□□□ 1.34
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SCAF8-204ENST00000461219 XBP1P17861 261 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 PSEN2P49810 448 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 SCRN1Q12765 414 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 MFSD10Q14728 455 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 JADE2Q9NQC1 790 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.39■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 MAFGO15525 162 aa23.38■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 ITGB5P18084 799 aa23.38■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGAP4P98171 946 aa23.38■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 SEMA3FQ13275 785 aa23.38■■□□□ 1.33
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.38■■□□□ 1.33
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