RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 GH1P01241 217 aa23.57■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 FIBPO43427 364 aa23.56■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 ALG1Q9BT22 464 aa23.56■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.56■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.56■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 EDIL3O43854 480 aa23.54■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 CYP3A4P08684 503 aa23.54■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 NLRX1Q86UT6 975 aa23.54■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 BLIDQ8IZY5 108 aa23.54■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 DPF3Q92784 378 aa23.54■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 TMX3Q96JJ7 454 aa23.54■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 MMP3P08254 477 aa23.52■■□□□ 1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 XBP1P17861 261 aa23.52■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.52■■□□□ 1.36
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RPUSD3-210ENST00000460909 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.51■■□□□ 1.35
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RPUSD3-210ENST00000460909 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.51■■□□□ 1.35
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RPUSD3-210ENST00000460909 PSMC6P62333 389 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 KRT40Q6A162 431 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 TBCKQ8TEA7 893 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 TNFRSF25Q93038 417 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 ARVCFO00192 962 aa23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 PPFIA4O75335 1185 aa23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 MMP1P03956 469 aa23.47■■□□□ 1.35
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