RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 ICAM3P32942 547 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA3FQ13275 785 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 GNPTABQ3T906 1256 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 CDH23Q9H251 3354 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 NID2Q14112 1375 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 CYP2C9P11712 490 aa27.21■■□□□ 1.95
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HOXB3-202ENST00000460160 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA33Q96N06 139 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 WNT8AQ9H1J5 351 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF286BP0CG31 522 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.19■■□□□ 1.94
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HOXB3-202ENST00000460160 FIBPO43427 364 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 F2P00734 622 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 NAPAP54920 295 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 CCL23P55773 120 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM240Q5SV17 173 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 RUFY3Q7L099 469 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 Q7L0L9 218 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB123Q8N688 67 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 SCN5AQ14524 2016 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PPFIA4O75335 1185 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ACRP10323 421 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 SESTD1Q86VW0 696 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 IL23AQ9NPF7 189 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 BARHL2Q9NY43 387 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PSEN2P49810 448 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 EVCP57679 992 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 HAS3O00219 553 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 NEDD9Q14511 834 aa27.16■■□□□ 1.94
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HOXB3-202ENST00000460160 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.16■■□□□ 1.94
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HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 METTL7BQ6UX53 244 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF365Q70YC5 407 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 SCLYQ96I15 445 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ITGB5P18084 799 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ADCY7P51828 1080 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 PTGISQ16647 500 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 RASIP1Q5U651 963 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 NLRX1Q86UT6 975 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 GPRASP2Q96D09 838 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 VWCEQ96DN2 955 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 ALG1Q9BT22 464 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 TET1Q8NFU7 2136 aa27.14■■□□□ 1.94
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HOXB3-202ENST00000460160 NTRK3Q16288 839 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 C7orf31Q8N865 590 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 NOD1Q9Y239 953 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB3-202ENST00000460160 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.14■■□□□ 1.94
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HOXB3-202ENST00000460160 PITPNM1O00562 1244 aa27.13■■□□□ 1.93
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HOXB3-202ENST00000460160 PKN1Q16512 942 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB3-202ENST00000460160 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB3-202ENST00000460160 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB3-202ENST00000460160 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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HOXB3-202ENST00000460160 PHKBQ93100 1093 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-202ENST00000460160 PGBD1Q96JS3 809 aa27.12■■□□□ 1.93
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