RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H0YGN5 161 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARVCFO00192 962 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEIS1O00470 390 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CPLX1O14810 134 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAMTS3O15072 1205 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPFIA4O75335 1185 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDKL5O76039 1030 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GH1P01241 217 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FDPSP14324 419 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGB5P18084 799 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PURAQ00577 322 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BEX3Q00994 111 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPY5RQ15761 445 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2SQ16763 222 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LY6KQ17RY6 165 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNPTABQ3T906 1256 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GALNT17Q6IS24 598 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COPS5Q92905 334 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FERMT2Q96AC1 680 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPRASP2Q96D09 838 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf50Q9HD87 102 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POLR3EQ9NVU0 708 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FIBPO43427 364 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EDIL3O43854 480 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RTP1P59025 263 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST3GAL1Q11201 340 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RABEP1Q15276 862 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXCL17Q6UXB2 119 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NIPA1Q7RTP0 329 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC148Q8NFR7 591 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPTC7Q8NI37 304 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BICD2Q8TD16 824 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDHR1Q96JP9 859 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GDF15Q99988 308 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANO3Q9BYT9 981 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JADE2Q9NQC1 790 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STARD7Q9NQZ5 370 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRVI1Q9Y6F6 885 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAMA3Q16787 3333 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA0355O15063 1070 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LARGE1O95461 756 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD4P01730 458 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CIITAP33076 1130 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMP8BP34820 402 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TLE2Q04725 743 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STK3Q13188 491 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEDD9Q14511 834 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 METTL7BQ6UX53 244 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR6J1Q8NGC5 347 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AFG1LQ8WV93 481 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MXRA8Q9BRK3 442 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MROH7Q68CQ1 1323 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HAS3O00219 553 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP9AO75110 1047 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP3P08254 477 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNA2P16389 499 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAAP100Q0VG06 881 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGA7Q13683 1181 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSDL1Q3SXM5 330 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM60Q495X7 471 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP55Q53EZ4 464 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NLRX1Q86UT6 975 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SESTD1Q86VW0 696 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM126BQ8IXS8 530 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KAT2BQ92831 832 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHF20Q9BVI0 1012 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BCAS3Q9H6U6 928 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM260Q9NX78 707 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RTEL1Q9NZ71 1219 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBX21Q9UL17 535 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GGPS1O95749 300 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F2P00734 622 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms