RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PSME4Q14997 1843 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIP5K2O43314 1243 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCY2DQ02846 1103 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAK2Q13177 524 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ODF2Q5BJF6 829 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA20Q8TB22 786 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RUBCNQ92622 972 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TSC22D3Q99576 134 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 12.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MAST3O60307 1309 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPREP23469 700 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP1P43487 201 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF5AQ12840 1032 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 BLMHQ13867 455 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KANK3Q6NY19 840 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 IFT20Q8IY31 132 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RAPGEF5Q92565 580 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MKL1Q969V6 931 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DYTNA2CJ06 578 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ18B7U540 433 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXA2O43364 376 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NCK2O43639 380 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM24O75264 130 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CSF1RP07333 972 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ABL2P42684 1182 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ANTXR2P58335 489 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ12Q14500 433 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRADDQ15628 312 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CD302Q8IX05 232 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CSRNP2Q9H175 543 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087X0B3 334 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD18B2RXH4 712 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MOCS3O95396 460 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GHRP10912 638 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP4AP20648 1035 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 USP4Q13107 963 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MFN1Q8IWA4 741 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A14Q96JA4 679 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFATQ9P243 1243 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SBF1O95248 1867 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R2C6 588 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MYZAPP0CAP1 466 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GYS1P13807 737 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFRSF8P28908 595 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAFAH1B1P43034 410 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DNA2P51530 1060 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ITIH3Q06033 890 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SLMAPQ14BN4 828 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPROQ16827 1216 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MICU3Q86XE3 530 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC7Q99615 494 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 EPAS1Q99814 870 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NDST4Q9H3R1 872 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms