RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLTBP09497 229 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMC2Q13753 1193 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNPTABQ3T906 1256 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LARGE1O95461 756 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GGPS1O95749 300 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGB5P18084 799 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGB8P26012 769 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANO3Q9BYT9 981 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FIBPO43427 364 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KPNA6O60684 536 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DTNBO60941 627 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ME3Q16798 604 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPTC7Q8NI37 304 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0355O15063 1070 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTDNEP1O95476 244 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AP3B2Q13367 1082 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEXIO95424 95 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD4P01730 458 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRX1Q86UT6 975 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NECAB1Q8N987 351 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KAT2BQ92831 832 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPRASP2Q96D09 838 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA33Q96N06 139 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AIFM3Q96NN9 605 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C6orf50Q9HD87 102 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBX21Q9UL17 535 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BMP8BP34820 402 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SREBF1P36956 1147 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DGKDQ16760 1214 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JADE2Q9NQC1 790 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP9AO75110 1047 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNA11P29992 359 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEDD9Q14511 834 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 METTL7BQ6UX53 244 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BADQ92934 168 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GTF3C6Q969F1 213 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LTBP2Q14767 1821 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4GALT4O60513 344 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDKL5O76039 1030 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF286BP0CG31 522 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNA2P16389 499 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTMR1Q13613 665 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPFIA4O75335 1185 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP4P98171 946 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ST3GAL1Q11201 340 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK36Q9NRP7 1315 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRP5P59047 1200 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPY5RQ15761 445 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP55Q53EZ4 464 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDHR1Q96JP9 859 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR20Q99678 358 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms