RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SCRN1Q12765 414 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 TOX2Q96NM4 488 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 GDF15Q99988 308 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 KPNA6O60684 536 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 PFKFB2O60825 505 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA3FQ13275 785 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ANO3Q9BYT9 981 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf50Q9HD87 102 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.63■■■□□ 2.17
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HTATSF1-202ENST00000425695 NLRX1Q86UT6 975 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA33Q96N06 139 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 FIBPO43427 364 aa28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 NECAB1Q8N987 351 aa28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 PRO3102Q9H379 93 aa28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ESYT2A0FGR8 921 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGB5P18084 799 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 DGKDQ16760 1214 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 PPTC7Q8NI37 304 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 BADQ92934 168 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 DEXIO95424 95 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 LARGE1O95461 756 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 RAG1P15918 1043 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGB8P26012 769 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 AP3B2Q13367 1082 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ME3Q16798 604 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 AIFM3Q96NN9 605 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
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HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0355O15063 1070 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 GNA11P29992 359 aa28.58■■■□□ 2.17
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HTATSF1-202ENST00000425695 NEDD9Q14511 834 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 GPRASP2Q96D09 838 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP9AO75110 1047 aa28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKL5O76039 1030 aa28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF286BP0CG31 522 aa28.57■■■□□ 2.16
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HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 KAT2BQ92831 832 aa28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.57■■■□□ 2.16
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HTATSF1-202ENST00000425695 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.57■■■□□ 2.16
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF76P36508 570 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 SP4Q02446 784 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 MTMR1Q13613 665 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF2CQ99661 725 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 TBX21Q9UL17 535 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
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HTATSF1-202ENST00000425695 CTDNEP1O95476 244 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 SREBF1P36956 1147 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 METTL7BQ6UX53 244 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 BICD2Q8TD16 824 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 CDHR1Q96JP9 859 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ALG1Q9BT22 464 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 LTBP2Q14767 1821 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP4P98171 946 aa28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 TIMP1P01033 207 aa28.53■■■□□ 2.16
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