RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424428.1

SLIT1-AS1-201, SLIT1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLIT1-AS1, Length 689 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PSEN2P49810 448 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NECTIN1Q15223 517 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NLRX1Q86UT6 975 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HOMER1Q86YM7 354 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 KAT2BQ92831 832 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SCLYQ96I15 445 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SPATA33Q96N06 139 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LY9Q9HBG7 655 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.3□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 VCANP13611 3396 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 H3BRB1 525 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PRC1O43663 620 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RGS20O76081 388 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GGPS1O95749 300 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CXCL10P02778 98 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PTGS1P23219 599 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 KCNJ6P48051 423 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IKBKEQ14164 716 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 KRT32Q14532 448 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MFSD10Q14728 455 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 METTL7BQ6UX53 244 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CHST3Q7LGC8 479 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LCTP09848 1927 aa9.29□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 EYSQ5T1H1 3165 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PBX2P40425 430 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RCAN1P53805 252 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ANTXR2P58335 489 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MCTP2Q6DN12 878 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SERINC5Q86VE9 423 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FANCBQ8NB91 859 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GPRASP2Q96D09 838 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 VWCEQ96DN2 955 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.28□□□□□ -0.92
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MEIS2O14770 477 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SLC27A2O14975 620 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CKBP12277 381 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HOXC8P31273 242 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 AAK1Q2M2I8 961 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RAD9AQ99638 391 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NRCAMQ92823 1304 aa9.27□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.26□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.26□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.26□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RSPH10BP0C881 870 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms