RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418795.3

FAM27E3-201, Transcript of family with sequence similarity 27 member E3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM27E3, Length 1,593 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3-201ENST00000418795 CLTBP09497 229 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 TGFB3P10600 412 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ITGB5P18084 799 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ITGB8P26012 769 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ICAM3P32942 547 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 NEK4P51957 841 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 LAMC2Q13753 1193 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 GNPTABQ3T906 1256 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 KIF2CQ99661 725 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ESYT2A0FGR8 921 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 CPLX1O14810 134 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 LARGE1O95461 756 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 GGPS1O95749 300 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 ANKRD1Q15327 319 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 PPTC7Q8NI37 304 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 LTBP2Q14767 1821 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3-201ENST00000418795 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 FIBPO43427 364 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 KPNA6O60684 536 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CD4P01730 458 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 ME3Q16798 604 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 KAT2BQ92831 832 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 AIFM3Q96NN9 605 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 ANO3Q9BYT9 981 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 KIAA0355O15063 1070 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CTDNEP1O95476 244 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 BMP8BP34820 402 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 AP3B2Q13367 1082 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 NECAB1Q8N987 351 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 SPATA33Q96N06 139 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 C6orf50Q9HD87 102 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 TBX21Q9UL17 535 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 B4GALT4O60513 344 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 ATP9AO75110 1047 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 DEXIO95424 95 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 DGKDQ16760 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 NLRX1Q86UT6 975 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 BADQ92934 168 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 GPRASP2Q96D09 838 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 JADE2Q9NQC1 790 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF286BP0CG31 522 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 KCNA2P16389 499 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 GNA11P29992 359 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 SREBF1P36956 1147 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 NEDD9Q14511 834 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 METTL7BQ6UX53 244 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 PPFIA4O75335 1185 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CHMP4BP1P59074 171 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 ARHGAP4P98171 946 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 MTMR1Q13613 665 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM27E3-201ENST00000418795 GTF3C6Q969F1 213 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms